Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GARNL3Q5VVW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms