Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTL8BQ17RB0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RTL8BQ17RB0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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