Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1R3AQ16821 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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