Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL23Q16540 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms