Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME3Q13232 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME3Q13232 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME3Q13232 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME3Q13232 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME3Q13232 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME3Q13232 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME3Q13232 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME3Q13232 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME3Q13232 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME3Q13232 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME3Q13232 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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