Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAG2P55895 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAG2P55895 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAG2P55895 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAG2P55895 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAG2P55895 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAG2P55895 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAG2P55895 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms