Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RND2P52198 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RND2P52198 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RND2P52198 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RND2P52198 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RND2P52198 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RND2P52198 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RND2P52198 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RND2P52198 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms