Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI1P19237 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms