Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARSP12081 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARSP12081 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HARSP12081 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARSP12081 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARSP12081 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARSP12081 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARSP12081 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARSP12081 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARSP12081 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARSP12081 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HARSP12081 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HARSP12081 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HARSP12081 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HARSP12081 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HARSP12081 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HARSP12081 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HARSP12081 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HARSP12081 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HARSP12081 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms