Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTA3P0C7M3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTA3P0C7M3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms