Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms