Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG12O94817 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG12O94817 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG12O94817 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG12O94817 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG12O94817 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG12O94817 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms