Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms