Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TUBGCP5-205ENST00000615383 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC007277.1-201ENST00000428156 2189 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FMO1-208ENST00000617670 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PPP1R1A-202ENST00000547431 2491 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RAPGEF3-219ENST00000549151 3265 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 VRTN-201ENST00000256362 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GRM3-203ENST00000439827 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC02170-202ENST00000562231 2218 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01600-201ENST00000624527 2434 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ATP2C2-202ENST00000416219 3472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 HLA-F-AS1-209ENST00000458236 2835 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PDE4C-203ENST00000447275 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NPAP1P6-201ENST00000440671 3484 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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