Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms