Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ZNF530-201ENST00000332854 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RN7SL279P-201ENST00000582185 284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NBR1Q14596 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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