Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDYN-203ENST00000540134 2472 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TCN2-201ENST00000215838 2535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC027682.7-201ENST00000623147 2121 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC239800.2-201ENST00000443018 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ADGRF3-201ENST00000311519 3240 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AL683813.1-201ENST00000435597 3018 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ELP2-201ENST00000350494 2487 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TCTE1-202ENST00000371505 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AP000821.1-201ENST00000567082 1909 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IGSF5-201ENST00000380588 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms