Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAG2P55895 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms