Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCFQ9NPI8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCFQ9NPI8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 670.3 ms