Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms