Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIH1Q9BYX4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms