Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms