Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PBDC1Q9BVG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms