Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HINFPQ9BQA5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINFPQ9BQA5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms