Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms