Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNKPQ96T60 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms