Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP3Q96P47 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms