Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1Q96NA8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms