Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BICD1Q96G01 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms