Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGF29Q96ES7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms