Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms