Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC4Q8WW27 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms