Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KBTBD3Q8NAB2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KBTBD3Q8NAB2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KBTBD3Q8NAB2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KBTBD3Q8NAB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KBTBD3Q8NAB2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KBTBD3Q8NAB2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KBTBD3Q8NAB2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms