Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CA13Q8N1Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CA13Q8N1Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CA13Q8N1Q1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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