Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC117Q8IWD4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms