Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms