Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD16Q68DU8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD16Q68DU8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms