Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC158Q5M9N0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms