Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms