Protein–RNA interactions for Protein: Q53H80

AKIRIN2, Akirin-2, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIRIN2Q53H80 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AKIRIN2Q53H80 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AKIRIN2Q53H80 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms