Protein–RNA interactions for Protein: Q53H80

AKIRIN2, Akirin-2, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIRIN2Q53H80 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
AKIRIN2Q53H80 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AKIRIN2Q53H80 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AKIRIN2Q53H80 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKIRIN2Q53H80 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKIRIN2Q53H80 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AKIRIN2Q53H80 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AKIRIN2Q53H80 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AKIRIN2Q53H80 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AKIRIN2Q53H80 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AKIRIN2Q53H80 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AKIRIN2Q53H80 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AKIRIN2Q53H80 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AKIRIN2Q53H80 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AKIRIN2Q53H80 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AKIRIN2Q53H80 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AKIRIN2Q53H80 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AKIRIN2Q53H80 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AKIRIN2Q53H80 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKIRIN2Q53H80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AKIRIN2Q53H80 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AKIRIN2Q53H80 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AKIRIN2Q53H80 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AKIRIN2Q53H80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AKIRIN2Q53H80 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AKIRIN2Q53H80 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKIRIN2Q53H80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKIRIN2Q53H80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKIRIN2Q53H80 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AKIRIN2Q53H80 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AKIRIN2Q53H80 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AKIRIN2Q53H80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AKIRIN2Q53H80 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AKIRIN2Q53H80 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AKIRIN2Q53H80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AKIRIN2Q53H80 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKIRIN2Q53H80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AKIRIN2Q53H80 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AKIRIN2Q53H80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AKIRIN2Q53H80 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKIRIN2Q53H80 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKIRIN2Q53H80 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AKIRIN2Q53H80 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AKIRIN2Q53H80 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AKIRIN2Q53H80 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AKIRIN2Q53H80 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AKIRIN2Q53H80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AKIRIN2Q53H80 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AKIRIN2Q53H80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AKIRIN2Q53H80 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AKIRIN2Q53H80 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKIRIN2Q53H80 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKIRIN2Q53H80 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AKIRIN2Q53H80 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AKIRIN2Q53H80 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIRIN2Q53H80 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIRIN2Q53H80 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIRIN2Q53H80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AKIRIN2Q53H80 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKIRIN2Q53H80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKIRIN2Q53H80 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKIRIN2Q53H80 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKIRIN2Q53H80 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKIRIN2Q53H80 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AKIRIN2Q53H80 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AKIRIN2Q53H80 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AKIRIN2Q53H80 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKIRIN2Q53H80 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AKIRIN2Q53H80 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKIRIN2Q53H80 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKIRIN2Q53H80 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AKIRIN2Q53H80 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AKIRIN2Q53H80 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AKIRIN2Q53H80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AKIRIN2Q53H80 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AKIRIN2Q53H80 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AKIRIN2Q53H80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKIRIN2Q53H80 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKIRIN2Q53H80 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKIRIN2Q53H80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKIRIN2Q53H80 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKIRIN2Q53H80 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKIRIN2Q53H80 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKIRIN2Q53H80 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKIRIN2Q53H80 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AKIRIN2Q53H80 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AKIRIN2Q53H80 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AKIRIN2Q53H80 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AKIRIN2Q53H80 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AKIRIN2Q53H80 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AKIRIN2Q53H80 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms