Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WBP11-205ENST00000544764 564 ntTSL 210.89□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WBP11-204ENST00000543316 554 ntTSL 210.89□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAB11FIP5-204ENST00000482554 2810 ntTSL 410.88□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZNF526-201ENST00000301215 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC25A22-204ENST00000524891 560 ntTSL 210.83□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 210.79□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CENPC-203ENST00000506882 3436 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 METAP1D-206ENST00000493035 929 ntTSL 210.68□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SMAD3-206ENST00000558739 586 ntTSL 310.67□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-216ENST00000532717 553 ntTSL 410.62□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ECH1-214ENST00000601094 440 ntTSL 210.52□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HTRA2-207ENST00000482205 564 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PTK7-209ENST00000470471 854 ntTSL 210.35□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC23A1-204ENST00000503919 559 ntTSL 410.34□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC25A11-203ENST00000570543 322 ntTSL 510.26□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-207ENST00000513263 694 ntTSL 210.25□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HTRA2-205ENST00000465521 745 ntTSL 210.22□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AMPD2-211ENST00000479919 690 ntTSL 310.03□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNTROB-211ENST00000576536 561 ntTSL 39.99□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-206ENST00000580219 1200 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-212ENST00000531851 773 ntTSL 39.94□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GIT1-215ENST00000586574 576 ntTSL 49.8□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-220ENST00000461066 692 ntTSL 59.71□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNAJC2-207ENST00000464253 1809 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBXO18-205ENST00000461504 835 ntTSL 59.62□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-213ENST00000584335 922 ntTSL 59.53□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZFHX2-AS1-203ENST00000556354 931 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 STK33-205ENST00000422559 767 ntTSL 59.49□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DYRK1B-207ENST00000601696 446 ntTSL 39.48□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DLG5-209ENST00000484525 315 ntTSL 29.46□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-207ENST00000578622 560 ntTSL 49.3□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-219ENST00000592729 543 ntTSL 59.24□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ECH1-205ENST00000595567 308 ntTSL 39.23□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RNF214-202ENST00000524917 545 ntTSL 49.17□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 METAP1D-207ENST00000493742 552 ntTSL 59.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-203ENST00000602291 766 ntTSL 39.08□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C18orf25-201ENST00000587591 668 ntTSL 48.93□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FKBP15-202ENST00000414250 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 48.79□□□□□ -16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-204ENST00000503182 578 ntTSL 48.76□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-206ENST00000513151 901 ntTSL 38.62□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-216ENST00000513111 595 ntTSL 58.58□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)8.41□□□□□ -1.067e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.087e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-213ENST00000588813 522 ntTSL 38.31□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RNF213-203ENST00000427003 3552 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-211ENST00000582481 627 ntTSL 28.15□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-212ENST00000441588 496 ntTSL 48.14□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-218ENST00000514895 220 ntTSL 28.13□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-205ENST00000578861 571 ntTSL 48.11□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FKBP15-203ENST00000446284 8807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-209ENST00000438191 426 ntTSL 57.93□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-211ENST00000438265 668 ntTSL 37.92□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ECH1-206ENST00000596118 356 ntTSL 37.69□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CUL4A-206ENST00000470067 794 ntTSL 27.67□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FKBP15-204ENST00000462889 575 ntTSL 37.65□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ECH1-209ENST00000597805 135 ntTSL 57.62□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-209ENST00000427817 580 ntTSL 37.56□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.216e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.216e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-203ENST00000504386 574 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-212ENST00000496991 703 ntTSL 37.36□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RNF214-208ENST00000534709 978 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-224ENST00000484868 318 ntTSL 37.14□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PSMD11-209ENST00000580904 540 ntTSL 47.1□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-203ENST00000408981 737 ntTSL 57.08□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.296e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-208ENST00000490450 424 ntTSL 36.9□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-235ENST00000532911 700 ntTSL 56.88□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RUFY1-214ENST00000514238 575 ntTSL 46.72□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 47.1
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