Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBRQ14739 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBRQ14739 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBRQ14739 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBRQ14739 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBRQ14739 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBRQ14739 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LBRQ14739 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBRQ14739 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBRQ14739 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBRQ14739 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms