Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EBI3Q14213 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EBI3Q14213 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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