Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTB1Q13884 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTB1Q13884 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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