Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 PRRC2C-205ENST00000463586 3771 ntTSL 25.59□□□□□ -1.513e-6■■■□□ 17.4
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TRA2AQ13595 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 519.11■□□□□ 0.653e-8■■■□□ 17.4
TRA2AQ13595 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■■■□□ 17.4
TRA2AQ13595 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.125e-6■■■□□ 17.4
TRA2AQ13595 SRRM1-223ENST00000600523 575 ntTSL 512.7□□□□□ -0.381e-7■■■□□ 17.4
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TRA2AQ13595 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.395e-6■■■□□ 17.4
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TRA2AQ13595 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 17.4
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TRA2AQ13595 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.352e-8■■■□□ 17.3
TRA2AQ13595 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.392e-8■■■□□ 17.3
TRA2AQ13595 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.72e-8■■■□□ 17.3
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TRA2AQ13595 PRC1-219ENST00000560914 673 ntTSL 26.7□□□□□ -1.343e-9■■■□□ 17.3
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TRA2AQ13595 PSMA7-206ENST00000486193 548 ntTSL 24.3□□□□□ -1.722e-14■■■□□ 17.3
TRA2AQ13595 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.574e-33■■■□□ 17.3
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TRA2AQ13595 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.921e-323■■■□□ 17.2
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TRA2AQ13595 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-323■■■□□ 17.2
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TRA2AQ13595 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 17
TRA2AQ13595 CHD1L-205ENST00000467213 2782 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.321e-7■■■□□ 17
TRA2AQ13595 CHD1L-208ENST00000488864 2415 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-7■■■□□ 17
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TRA2AQ13595 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-7■■■□□ 17
TRA2AQ13595 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 214.73□□□□□ -0.051e-58■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 UBC-211ENST00000542416 517 ntTSL 49.02□□□□□ -0.971e-58■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GARS-205ENST00000470392 469 ntTSL 52.9□□□□□ -1.951e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GARS-202ENST00000444666 619 ntTSL 32.56□□□□□ -21e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.931e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 17
TRA2AQ13595 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-9■■■□□ 17
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TRA2AQ13595 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-9■■■□□ 17
TRA2AQ13595 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.294e-9■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.255e-8■■■□□ 17
TRA2AQ13595 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.755e-8■■■□□ 17
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