Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2V1Q13404 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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