Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA4Q13156 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA4Q13156 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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