Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
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