Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2BQ00403 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms